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Subjectext3 inode cache eats system, news at 11
From
Date
One of the remaining bits of weirdness with my x86_64 system has been that
I often find it unresponsive in the morning; it's harder to get out of bed
than my middle-school son. Some things happen (the pointer moves in
response to the mouse) but everything on the system seems asleep. Very
little disk activity happens. Eventually, usually, the system comes back
to life, but that can take 15-30 minutes.

I've managed to correlate this behavior with processes which read through
the whole disk. The nightly updatedb run is the worst offender, but a full
backup of the disk can do it as well.

A look at /proc/meminfo (appended below) shows that the bulk of main memory
is taken up by the slab cache. I'll append a full slabinfo listing as
well, but two things stand out:

ext3_inode_cache 488356 488978 1128 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 69854 69854 0 : globalstat 503845 489160 71492 0 0 4 31 : cpustat 432956 71842 15175 1288
dentry_cache 623017 623018 344 11 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 56638 56638 0 : globalstat 844725 739068 73219 3 0 3 43 : cpustat 773061 75754 211980 13818

Of my 800MB of slab use, those two are responsible for 755MB.

This is a vanilla 2.6.5 kernel on an x86_64 system.

Any thoughts on what's going on here? Any other information which would be
useful?

Thanks,

jon

/proc/meminfo looks like:

MemTotal: 1025088 kB
MemFree: 86292 kB
Buffers: 27444 kB
Cached: 21468 kB
SwapCached: 0 kB
Active: 84008 kB
Inactive: 27444 kB
HighTotal: 0 kB
HighFree: 0 kB
LowTotal: 1025088 kB
LowFree: 86292 kB
SwapTotal: 1024120 kB
SwapFree: 1024120 kB
Dirty: 0 kB
Writeback: 116 kB
Mapped: 82224 kB
Slab: 807316 kB
Committed_AS: 230944 kB
PageTables: 7112 kB
VmallocTotal: 536870911 kB
VmallocUsed: 17884 kB
VmallocChunk: 536853027 kB

And slabinfo is:

slabinfo - version: 2.0 (statistics)
# name <active_objs> <num_objs> <objsize> <objperslab> <pagesperslab> : tunables <batchcount> <limit> <sharedfactor> : slabdata <active_slabs> <num_slabs> <sharedavail> : globalstat <listallocs> <maxobjs> <grown> <reaped> <error> <maxfreeable> <freelimit> : cpustat <allochit> <allocmiss> <freehit> <freemiss>
nfs_write_data 36 40 816 5 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 8 8 0 : globalstat 44 40 8 0 0 0 37 : cpustat 37 9 10 0
nfs_read_data 32 35 784 5 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 7 7 0 : globalstat 38 35 7 0 0 0 37 : cpustat 27 8 3 0
nfs_inode_cache 10 12 1216 3 1 : tunables 24 12 0 : slabdata 4 4 0 : globalstat 16 12 4 0 0 0 27 : cpustat 5 7 2 0
nfs_page 0 0 208 19 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 16 16 1 1 0 0 51 : cpustat 8 1 9 0
rpc_buffers 8 9 2072 3 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 3 3 0 : globalstat 9 9 3 0 0 0 27 : cpustat 5 3 0 0
rpc_tasks 8 9 400 9 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 10 9 1 0 0 0 41 : cpustat 8 2 2 0
rpc_inode_cache 10 14 1136 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 2 2 0 : globalstat 14 14 2 0 0 0 31 : cpustat 8 2 0 0
unix_sock 157 160 1024 4 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 40 40 0 : globalstat 242 176 47 7 0 0 36 : cpustat 1379 64 1286 0
tcp_tw_bucket 2 24 160 24 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 128 18 6 5 0 0 56 : cpustat 23 8 29 0
tcp_bind_bucket 12 67 56 67 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 176 32 1 0 0 0 99 : cpustat 30 11 29 0
tcp_open_request 0 0 104 37 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 32 16 2 2 0 0 69 : cpustat 8 2 10 0
inet_peer_cache 0 0 96 40 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 16 16 1 1 0 0 72 : cpustat 0 1 1 0
secpath_cache 0 0 160 24 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 56 : cpustat 0 0 0 0
xfrm_dst_cache 0 0 360 11 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 43 : cpustat 0 0 0 0
ip_fib_hash 11 77 48 77 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 16 16 1 0 0 0 109 : cpustat 12 1 2 0
ip_dst_cache 13 22 360 11 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 2 2 0 : globalstat 152 33 3 1 0 0 43 : cpustat 45 14 46 0
arp_cache 3 11 336 11 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 47 11 1 0 0 0 43 : cpustat 1 5 3 0
raw4_sock 0 0 1040 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 7 7 1 1 0 0 31 : cpustat 3 1 4 0
udp_sock 8 14 1048 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 2 2 0 : globalstat 24 14 2 0 0 0 31 : cpustat 52 4 48 0
tcp_sock 14 14 1840 2 1 : tunables 24 12 0 : slabdata 7 7 0 : globalstat 37 16 18 11 0 0 26 : cpustat 145 19 150 0
flow_cache 0 0 136 28 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 60 : cpustat 0 0 0 0
uhci_urb_priv 1 34 112 34 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 32 16 2 1 0 0 66 : cpustat 6020 2 6021 0
scsi_cmd_cache 2 8 512 8 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 8 8 1 0 0 0 40 : cpustat 65 1 64 0
isofs_inode_cache 0 0 872 9 2 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 41 : cpustat 0 0 0 0
ext2_inode_cache 0 0 960 4 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 36 : cpustat 0 0 0 0
journal_handle 2 53 72 53 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 1248 17 65 64 0 0 85 : cpustat 73166 78 73244 0
journal_head 5709 5814 112 34 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 171 171 0 : globalstat 29999 6272 349 19 0 1 66 : cpustat 34786 2152 29833 1398
revoke_table 10 91 40 91 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 32 18 1 0 0 0 123 : cpustat 8 2 0 0
revoke_record 0 0 56 67 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 48 16 3 3 0 0 99 : cpustat 7 3 10 0
ext3_inode_cache 504677 504707 1128 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 72098 72101 0 : globalstat 528110 505001 74279 1 0 4 31 : cpustat 454350 75045 22779 1950
ext3_xattr 0 0 112 34 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 66 : cpustat 0 0 0 0
eventpoll_pwq 0 0 96 40 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 72 : cpustat 0 0 0 0
eventpoll_epi 0 0 152 25 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 57 : cpustat 0 0 0 0
kioctx 0 0 520 7 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 39 : cpustat 0 0 0 0
kiocb 0 0 320 12 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 44 : cpustat 0 0 0 0
dnotify_cache 3 59 64 59 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 16 16 1 0 0 0 91 : cpustat 2 1 0 0
file_lock_cache 3 17 232 17 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 215 17 2 1 0 0 49 : cpustat 3018 15 3030 0
fasync_cache 2 77 48 77 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 16 16 1 0 0 0 109 : cpustat 1 1 0 0
shmem_inode_cache 10 14 1080 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 2 2 0 : globalstat 39 14 2 0 0 0 31 : cpustat 6 8 4 0
posix_timers_cache 0 0 256 15 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 47 : cpustat 0 0 0 0
uid_cache 10 59 64 59 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 32 18 1 0 0 0 91 : cpustat 9 2 1 0
sgpool-128 32 32 4096 1 1 : tunables 24 12 0 : slabdata 32 32 0 : globalstat 32 32 32 0 0 0 25 : cpustat 0 32 0 0
sgpool-64 32 33 2072 3 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 11 11 0 : globalstat 33 33 11 0 0 0 27 : cpustat 21 11 0 0
sgpool-32 32 35 1048 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 5 5 0 : globalstat 35 35 5 0 0 0 31 : cpustat 27 5 0 0
sgpool-16 32 35 536 7 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 5 5 0 : globalstat 35 35 5 0 0 0 39 : cpustat 27 5 0 0
sgpool-8 32 42 280 14 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 3 3 0 : globalstat 42 42 3 0 0 0 46 : cpustat 29 3 0 0
deadline_drq 0 0 120 32 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 64 : cpustat 0 0 0 0
as_arq 79 84 136 28 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 3 3 0 : globalstat 5254 240 79 27 0 1 60 : cpustat 93815 350 93866 227
blkdev_requests 78 78 288 13 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 6 6 0 : globalstat 4928 247 196 89 0 1 45 : cpustat 93739 426 93869 224
biovec-BIO_MAX_PAGES 256 256 4096 1 1 : tunables 24 12 0 : slabdata 256 256 0 : globalstat 280 280 280 24 0 0 25 : cpustat 130 280 154 0
biovec-128 256 258 2072 3 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 86 86 0 : globalstat 272 270 90 4 0 0 27 : cpustat 262 91 97 0
biovec-64 256 259 1048 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 37 37 0 : globalstat 306 280 40 3 0 0 31 : cpustat 448 49 241 0
biovec-16 256 266 280 14 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 19 19 0 : globalstat 590 266 19 0 0 0 46 : cpustat 1833 52 1629 0
biovec-4 258 258 88 43 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 6 6 0 : globalstat 570 274 19 13 0 0 75 : cpustat 1421 78 1243 0
biovec-1 343 364 40 91 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 4 4 0 : globalstat 29681 776 162 29 0 1 123 : cpustat 119410 1925 119276 1726
bio 336 352 120 32 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 11 11 0 : globalstat 27975 832 536 87 0 2 64 : cpustat 127754 1760 127566 1615
sock_inode_cache 182 184 968 4 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 46 46 0 : globalstat 296 200 57 11 0 0 36 : cpustat 1176 75 1069 0
skbuff_head_cache 418 450 256 15 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 30 30 0 : globalstat 592 450 30 0 0 0 47 : cpustat 242750 39 242391 10
sock 2 9 840 9 2 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 52 9 1 0 0 0 41 : cpustat 24 7 29 0
proc_inode_cache 328 369 880 9 2 : tunables 32 16 0 : slabdata 41 41 0 : globalstat 954 459 54 4 0 1 41 : cpustat 43712 94 43471 20
sigqueue 17 21 184 21 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 64 18 1 0 0 0 53 : cpustat 27228 4 27231 0
radix_tree_node 1804 2660 544 7 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 380 380 0 : globalstat 13843 10381 1483 2 0 2 39 : cpustat 14785 1708 14070 640
bdev_cache 10 14 1040 7 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 2 2 0 : globalstat 21 14 2 0 0 0 31 : cpustat 65 4 59 0
mnt_cache 26 28 136 28 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 49 28 1 0 0 0 60 : cpustat 24 5 3 0
inode_cache 1437 1449 848 9 2 : tunables 32 16 0 : slabdata 161 161 0 : globalstat 1741 1449 161 0 0 0 41 : cpustat 2198 186 947 0
dentry_cache 591866 591866 344 11 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 53806 53806 0 : globalstat 866469 739068 74379 3 0 3 43 : cpustat 793511 77496 262026 17120
filp 1571 1596 312 12 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 133 133 0 : globalstat 3242 1656 156 12 0 2 44 : cpustat 133936 254 132546 73
names_cache 2 2 4096 1 1 : tunables 24 12 0 : slabdata 2 2 0 : globalstat 170 5 77 75 0 0 25 : cpustat 992031 166 992196 0
idr_layer_cache 3 7 552 7 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 7 7 1 0 0 0 39 : cpustat 2 1 0 0
buffer_head 7276 31744 120 32 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 992 992 0 : globalstat 93855 60576 2058 4 0 2 64 : cpustat 101591 5867 94918 5288
mm_struct 69 69 1352 3 1 : tunables 24 12 0 : slabdata 23 23 0 : globalstat 216 78 40 17 0 0 27 : cpustat 2954 83 2969 0
vm_area_struct 4414 4450 152 25 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 178 178 0 : globalstat 52668 4916 668 13 0 2 57 : cpustat 99786 3596 96034 2942
fs_cache 90 96 80 48 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 2 2 0 : globalstat 590 94 2 0 0 0 80 : cpustat 1778 38 1741 0
files_cache 72 72 888 9 2 : tunables 32 16 0 : slabdata 8 8 0 : globalstat 270 81 14 6 0 0 41 : cpustat 1760 49 1741 0
signal_cache 109 129 88 43 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 3 3 0 : globalstat 617 113 4 1 0 0 75 : cpustat 1918 43 1867 0
sighand_cache 93 93 2128 3 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 31 31 0 : globalstat 195 99 42 11 0 0 27 : cpustat 1879 79 1867 0
task_struct 96 96 2304 3 2 : tunables 24 12 0 : slabdata 32 32 0 : globalstat 217 102 54 22 0 0 27 : cpustat 1884 80 1868 0
pte_chain 15989 16107 64 59 1 : tunables 32 16 0 : slabdata 273 273 0 : globalstat 78859 16831 405 2 0 1 91 : cpustat 97169 5057 82371 3873
size-131072(DMA) 0 0 131072 1 32 : tunables 8 4 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 9 : cpustat 0 0 0 0
size-131072 0 0 131072 1 32 : tunables 8 4 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 9 : cpustat 0 0 0 0
size-65536(DMA) 0 0 65536 1 16 : tunables 8 4 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 9 : cpustat 0 0 0 0
size-65536 1 1 65536 1 16 : tunables 8 4 0 : slabdata 1 1 0 : globalstat 1 1 1 0 0 0 9 : cpustat 0 1 0 0
size-32768(DMA) 0 0 32768 1 8 : tunables 8 4 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 9 : cpustat 0 0 0 0
size-32768 0 0 32768 1 8 : tunables 8 4 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 1 1 1 1 0 0 9 : cpustat 0 1 1 0
size-16384(DMA) 0 0 16384 1 4 : tunables 8 4 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 9 : cpustat 0 0 0 0
size-16384 6 6 16384 1 4 : tunables 8 4 0 : slabdata 6 6 0 : globalstat 67 9 54 48 0 0 9 : cpustat 75388 67 75449 0
size-8192(DMA) 0 0 8192 1 2 : tunables 8 4 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 9 : cpustat 0 0 0 0
size-8192 21 21 8192 1 2 : tunables 8 4 0 : slabdata 21 21 0 : globalstat 76 24 63 42 0 0 9 : cpustat 2615 74 2668 0
size-4096(DMA) 0 0 4096 1 1 : tunables 24 12 0 : slabdata 0 0 0 : globalstat 0 0 0 0 0 0 25 : cpustat 0 0 0 0
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